Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACKR4Q9NPB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACKR4Q9NPB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACKR4Q9NPB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms