Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3GQ9HC16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3GQ9HC16 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms