Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK3Q9H422 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIPK3Q9H422 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIPK3Q9H422 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIPK3Q9H422 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms