Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCOLN1Q9GZU1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MCOLN1Q9GZU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCOLN1Q9GZU1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCOLN1Q9GZU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MCOLN1Q9GZU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCOLN1Q9GZU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms