Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM5Q9C035 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM5Q9C035 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms