Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM9Q9C026 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM9Q9C026 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms