Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN4RQ9BZR6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTN4RQ9BZR6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms