Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIFKQ9BYG3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIFKQ9BYG3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms