Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SCAPERQ9BY12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SCAPERQ9BY12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAPERQ9BY12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCAPERQ9BY12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms