Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS2Q9BXC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS2Q9BXC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS2Q9BXC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS2Q9BXC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms