Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSG1Q9BU20 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms