Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MESP1Q9BRJ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms