Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF2Q99470 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDF2Q99470 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDF2Q99470 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms