Protein–RNA interactions for Protein: Q96T25

ZIC5, Zinc finger protein ZIC 5, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC5Q96T25 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZIC5Q96T25 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZIC5Q96T25 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZIC5Q96T25 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms