Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERGIC2Q96RQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERGIC2Q96RQ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERGIC2Q96RQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERGIC2Q96RQ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERGIC2Q96RQ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms