Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP4Q96PP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBP4Q96PP9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP4Q96PP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms