Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
INPP4AQ96PE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INPP4AQ96PE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms