Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD6Q96NK8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD6Q96NK8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD6Q96NK8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEUROD6Q96NK8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD6Q96NK8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms