Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD4Q96M96 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD4Q96M96 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms