Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC114Q96M63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC114Q96M63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms