Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf48Q96LL4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C8orf48Q96LL4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms