Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERAC1Q96JX3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERAC1Q96JX3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms