Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CCDC136Q96JN2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC136Q96JN2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC136Q96JN2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms