Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF479Q96JC4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms