Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALML4Q96GE6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALML4Q96GE6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms