Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGBD4Q96DM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD4Q96DM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD4Q96DM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms