Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MR1Q95460 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MR1Q95460 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MR1Q95460 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MR1Q95460 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MR1Q95460 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MR1Q95460 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MR1Q95460 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MR1Q95460 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MR1Q95460 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MR1Q95460 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MR1Q95460 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MR1Q95460 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MR1Q95460 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MR1Q95460 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MR1Q95460 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MR1Q95460 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MR1Q95460 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MR1Q95460 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MR1Q95460 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MR1Q95460 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MR1Q95460 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MR1Q95460 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MR1Q95460 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MR1Q95460 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MR1Q95460 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MR1Q95460 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MR1Q95460 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MR1Q95460 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MR1Q95460 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MR1Q95460 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MR1Q95460 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MR1Q95460 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MR1Q95460 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MR1Q95460 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MR1Q95460 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MR1Q95460 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MR1Q95460 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MR1Q95460 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MR1Q95460 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MR1Q95460 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MR1Q95460 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MR1Q95460 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MR1Q95460 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MR1Q95460 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MR1Q95460 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MR1Q95460 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MR1Q95460 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MR1Q95460 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MR1Q95460 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MR1Q95460 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MR1Q95460 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MR1Q95460 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MR1Q95460 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MR1Q95460 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MR1Q95460 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MR1Q95460 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MR1Q95460 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MR1Q95460 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MR1Q95460 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MR1Q95460 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MR1Q95460 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MR1Q95460 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 688.4 ms