Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS9Q8WXC6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms