Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APH1BQ8WW43 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APH1BQ8WW43 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APH1BQ8WW43 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms