Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3BQ8TF42 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms