Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD35

LKAAEAR1, Protein LKAAEAR1, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LKAAEAR1Q8TD35 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LKAAEAR1Q8TD35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LKAAEAR1Q8TD35 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LKAAEAR1Q8TD35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LKAAEAR1Q8TD35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms