Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC112Q8NEF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC112Q8NEF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms