Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CARMIL3Q8ND23 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CARMIL3Q8ND23 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL3Q8ND23 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CARMIL3Q8ND23 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms