Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP11CQ8NB49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11CQ8NB49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP11CQ8NB49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1529 ms