Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APRG1Q8IVJ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APRG1Q8IVJ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APRG1Q8IVJ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APRG1Q8IVJ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APRG1Q8IVJ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APRG1Q8IVJ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APRG1Q8IVJ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APRG1Q8IVJ8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms