Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM73Q86UV7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms