Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00596Q86U02 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00596Q86U02 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms