Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00173Q6ZV60 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms