Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00336Q6ZUF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00336Q6ZUF6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms