Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD1Q6UWL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms