Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX30Q5VWJ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX30Q5VWJ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms