Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BROXQ5VW32 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BROXQ5VW32 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms