Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ANKRD20A3Q5VUR7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD20A3Q5VUR7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.2 ms