Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACER2Q5QJU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER2Q5QJU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER2Q5QJU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms