Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLRC3Q5JS37 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLRC3Q5JS37 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC3Q5JS37 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms