Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACSM3Q53FZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACSM3Q53FZ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms