Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUSP28Q4G0W2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUSP28Q4G0W2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms