Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTDC1Q4AE62 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTDC1Q4AE62 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTDC1Q4AE62 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTDC1Q4AE62 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms