Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM50Q3ZCQ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms