Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
FHOD3Q2V2M9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FHOD3Q2V2M9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
FHOD3Q2V2M9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
FHOD3Q2V2M9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
FHOD3Q2V2M9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms